Bonjour, J'ai récemment lu ça sur Ouest France : on vous a montré cette photo avec la légende : « test du Covid19 » ça m'a énervé... ça a l'air tellement simple qu'on se demande pourquoi on n'en fait pas à toute la population ! Seulement voilà, c'est juste un tout petit peu plus compliqué ! Ce tube contient seulement un liquide et l'écouvillon avec lequel on a prélevé dans le nez du patient. Il permet de transporter et protéger les cellules et les virus qu'il contient vers le labo où sera fait l'analyse. Comment se fait le test ? 2 étapes : 1 récupérer les acides nucléiques (ADN et ARN) qu'il contient 2 aller à la pêche pour amplifier l'ARN du Covid19 (PCR) 1- purification : après avoir bien touillé le liquide avec l'écouvillon, on récupère 0,2ml qu'on met immédiatement dans un tube qui contient une solution pour détruire les cellules et l'enveloppe du virus qu'elles contiennent pour libérer les acides nucléiques (AN : ADN et ARN). Là le virus est mort et on ne risque plus rien. Cette « soupe » est placée dans un automate qui va récupérer les AN et les dissoudre dans un liquide propre. Ca prend 45mn 2 On récupère 0,005ml (C pas bcp) de ce liquide que l'on dépose dans un nouveau tube qui contient 0,020ml d'un mélange où on va amplifier l'ARN du virus pour qu'il soit détectable. A l'échelle moléculaire, c'est repérer un gardon dans le lac de Genève
Comment ça marche : je vais prendre un exemple Vous voyez le lac de St julien (plus petit), il est plein de poissons différents et celui qu'on cherche est bien planqué avec les autres beaucoup plus nombreux. Alors on va multiplier le nombre de poissons Covid19 pour le démasquer : Si le Covid19 est présent, on va l'accrocher avec une amorce qui ne s'accroche qu'à lui et à partir d'un poisson Covid19, on va en créer 2, avec les 2 on en fait 4, avec les 4 on en fait 8, et ainsi de suite:16, 32, 64, 128, 256, 512, 1024 quand on a fait ça 45 fois, (45 cycles) on peut mathématiquement en avoir 2 exposant 45 ça fait beaucoup ! C'est ce qu'on appelle une réaction en chaîne (PCR : Polymerase Chain Reaction) on vous parle des fois du test PCR et bien c'est ça. Il faut 1h30 dans un automate : le thermocycleur Ben oui mais comment on les voit les nouveaux poissons ? me direz vous Imaginez : à chaque fois qu'on crée un nouveau poisson, on allume une led dans le lac de St Yo, on place un drone avec une camera au dessus du lac qui va pouvoir détecter l'augmentation de la lumière
En vrai ça donne ça : courbe de l'intensité lumineuse
Ici la lumière (fluorescente) à été détectée dans le tube à partir du 25ème cycle et ils ont fait 50 cycles d'amplification. Évidemment plus vous avez de virus au départ et moins vous aurez besoin de cycles pour atteindre le seuil de détection, ça donne une idée du nombre de virus présents dans le prélèvement. En plaçant dans la série des tubes qui contiennent une quantité connue d'ADN viral, on peut même calculer le nombre de virus contenus dans l'échantillon de départ. Un peu de biologie moléculaire (si ça vous échappe demandez à vos bacheliers de l'année) Vous connaissez les briques (bases) qui composent l'ADN : A T C G L'amorce qui accroche le poisson c'est un petit morceau d'ADN avec une suite de 20 bases ATCG que l'on a fabriqué à partir de la séquence complète du génome viral publié par les chinois. GGCATTCGGACCTGATGGCATGCCCTTACCetc-------(genome du virus) TAAGCCTGGACTACCGTAC (amorce) le A s'accroche au T et le G s'accroche au C cette suite de bases a été choisie pour être unique et caractéristique du virus, elle ne peux pas accrocher aucune autre séquence. Une fois accroché, la suite de la multiplication de la séquence du virus se passe aussi au niveau de la séquence en utilisant des A T C G ,une enzyme (polymerase) qui va les accrocher en face de la séquence ciblée à partir d'amorces spécifiques. On utilise un marqueur fluorescent qui va émettre de la lumière à chaque nouvelle copie réalisée. Il y a des vidéo et des Schéma explicatifs sur le net, je pourrai aussi vous en dire plus si ça vous intéresse. Je vous remercie d'avoir lu jusqu'au bout (le mélange pour faire la PCR est fabriqué au labo, y'a pas que les allemands qui sachent faire ça!)
Et Voici le mot que Céline m'a envoyé :
Tout d'abord merci de maintenir les liens du club en alimentant le site.
Les petits mots des uns et des autres sont forts et fédérateurs.
De mon côté à défaut de transpirer en faisant du sport ,
le sport m'a inspirée, alors à mon tour je partage ce petit texte, un jeu qui pourra si tu le souhaites être proposé à nos sportifs du RCN